Tomcatプロジェクトは、 Sun Microsystemsで、Java ServletとJava Server Pages仕様のリファレンス実装としてスタートしました。その仕様の全詳細はJavaコミュニティプロセス（JCP）サイトにあります。
Tomcatコードベースは、1999年にSunからApacheソフトウェアファウンデーションに寄贈され、最初のApache Tomcat®リリースはバージョン3.0でした。それ以来、Sunやその他多数の組織の有志が製品に貢献してきました。製品は複数の大規模リリースがあり、業界から広く採用されており、健全で活発なコミュニティも存在しています。
2005年にTomcatはApache独自のトップレベルプロジェクトになり、Jakartaの傘下と監督体制から離れて、独自に管理するようになりました。